- Wytyczne w zakresie sprawozdawczości Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko
- Wytyczne w zakresie kwalifikowania wydatków w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko (obowiązuje od 02.06.2015 r.)
- Wytyczne w zakresie kontroli realizacji Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko 2007 - 2013 (obowiązuje od 28.05.2013 r.)
wytyczne w zakresie kontroli
załączniki do wytycznych - Zalecenia Instytucji Zarządzającej Programem Operacyjnym Infrastruktura i Środowisko dotyczące rozliczania i dokumentowania przedsięwzięć realizowanych siłami własnymi w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko - dokument z dnia 1 lipca 2010
- Zalecenia w zakresie wzoru wniosku beneficjenta o płatność w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko (obowiązuje od 15.10.2010 r.)
- Wytyczne w zakresie sposobu korygowania wydatków nieprawidłowo poniesionych w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko (obowiązuje od 29.04.2013 r.)
- Wytyczne w zakresie przechowywania i udostępniania dokumentów w ramach Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko 2007-2013 (obowiązuje od 25.08.2015 r.)